肿瘤是一种病因复杂且异质性极高的疾病,发病机制尚不完全清楚。快速发展的肿瘤大数据(如基因组及转录组数据)积累,为甄别新的肿瘤相关基因、深入理解肿瘤发生发展的分子机制提供了绝佳的契机。
中国科学院昆明动物研究所孔庆鹏课题组通过分析来自 TCGA (The Cancer Genome Atlas) 数据库的 12 种肿瘤的转录组数据发现:ERCC6L 基因在 12 种肿瘤中都非常一致地显著高表达。该基因是一个新近发现的 DNA 解旋酶,与胚胎发育息息相关,然而与肿瘤的关系却从未见报道。研究人员首先通过体外细胞实验发现,沉默 ERCC6L 可显著抑制乳腺癌细胞(MCF-7, MDA-MB-231)和肾癌细胞(786-0)的增殖,细胞周期被阻滞在 G0/G1 期。进一步分析 ERCC6L 敲降后的细胞转录组数据及验证实验发现:ERCC6L 敲降可显著抑制 RAB31 基因的转录和翻译水平,同时降低 RAB31 下游的 MAPK 途径的磷酸化水平和 CDK2 的蛋白表达。为了验证体外实验结果,课题组进行了裸鼠成瘤实验,结果显示:沉默 ERCC6L 可于瘤细胞接种后的第七天就开始显著抑制肿瘤生长。不仅如此,ERCC6L 表达水平与患者的肿瘤分期高度相关,且 ERCC6L 高表达可预示肿瘤患者的低生存率,提示 ERCC6L 是肿瘤预后的良好标记物,同时也是肿瘤治疗和药物开发的一个潜在靶点。
该研究成果近期发表于 Oncotarget 杂志。课题组成员浦绍艳和博士研究生余琴为文章的共同第一作者,研究员孔庆鹏和副研究员何永捍为文章的并列通讯作者。
该项目得到了科技部“973”项目、国家自然科学基金及中科院等研究基金项目的支持。